O que é pontuação de risco poligênico?

Jessica Greenwood

O que é pontuação de risco poligênico?

Você já se perguntou se as doenças cardíacas têm algum componente genético? E o diabetes tipo 2? Ou câncer de mama? Existe uma nova técnica que visa combinar testes de DNA com modelagem matemática para responder a essa pergunta em nível pessoal. É chamado de pontuação de risco poligênico (PRS). Mas o que exatamente é uma pontuação de risco poligênico?

Por definição, “poligênico” significa “mais de um gene”. E, ao contrário de muitas definições em saúde, este descreve com precisão seu significado. Algumas condições de saúde são monogênicas, o que significa que são causadas por uma variante patogênica ou causadora de doença em um único gene. Por exemplo, a fibrose cística é uma condição monogênica causada por uma única mutação no gene CFTR. Embora existam centenas de condições monogênicas, o número total de pessoas afetadas por qualquer uma dessas condições é bastante pequeno. Traços comuns, por outro lado, como obesidade e pressão alta, e doenças como doenças cardíacas e diabetes, afetam um número significativo da população mundial. A predisposição para essas características e doenças é realmente controlada por uma combinação de muitos genes. Eles são, por essa definição, poligênicos. Para fornecer uma avaliação de risco precisa para essas condições, precisamos examinar os riscos individuais que uma pessoa possui em muitos locais do genoma e combiná-los. O resultado cumulativo desses riscos combinados é chamado de pontuação de risco poligênico.

Como é calculado uma PRS?

Para determinar uma pontuação de risco poligênica, primeiro é necessário avaliar seu risco combinado em centenas, milhares ou até milhões de variantes. Cada uma dessas variantes geralmente dá uma pequena contribuição ao seu risco geral para a condição. Para determinar esse risco geral, precisamos modelar como somar a contribuição de todas essas variantes.

O modelo matemático usado para calcular uma PRS leva em consideração duas coisas – as variantes encontradas no seu DNA e o impacto de cada uma dessas variantes na probabilidade de você desenvolver a doença.

O conhecimento de quais variantes testar vem de uma extensa revisão dos chamados estudos de associação em todo o genoma, GWAS. Os estudos da GWAS incluem milhares a milhões de pessoas, geralmente de uma população étnica específica, algumas das quais têm a doença ou característica complexa em questão. Milhões de variantes em seus genomas são testadas e os resultados das pessoas com a doença são comparados com os que não têm, para ver como suas variantes diferem. Isso cria uma imagem das variantes mais comuns em pessoas com a doença e nos diz quais variantes procurar na amostra de DNA enviada por um kit de saúde.

Cada variante tem uma contribuição única para o risco geral da doença. Isso é chamado de “tamanho do efeito”. O modelo matemático leva esse tamanho de efeito em consideração, dando mais peso às variantes com tamanhos de efeito maiores do que aquelas com tamanhos de efeito menores. Portanto, quando uma amostra é enviada, ela é testada para as variantes identificadas nos estudos do GWAS, e os resultados são inseridos no modelo. O modelo calcula o tamanho do efeito em cada variante e avalia o risco correspondente. A PRS é a soma dos seus riscos individuais em cada uma dessas variantes.

 

Consideração com PRS

Atualmente, os relatórios PRS estão disponíveis apenas para os descendentes de europeus. Isso ocorre porque a grande maioria dos estudos do GWAS realizados analisou principalmente pessoas de origem étnica. Como pode haver diferenças nas variantes que causam doenças entre pessoas de diferentes grupos étnicos, são necessários estudos da GWAS em cada grupo étnico principal antes que a PRS possa ser calculado com segurança para pessoas de ascendência não européia. Felizmente, esforços de pesquisa em larga escala em todo o mundo estão em andamento para tentar solucionar esse problema. À medida que esses dados são divulgados, os relatórios da PRS ficam disponíveis para os de outras etnias.

A outra coisa a considerar com a PRS é que ela é mais valiosa quando vista como parte de uma imagem holística da saúde. Condições como doenças cardíacas e obesidade são amplamente influenciadas por fatores do estilo de vida, como dieta, exercício e IMC, que você pode controlar. A PRS é um guia que ajuda a identificar pessoas que podem não saber que têm um risco genético, permitindo que elas e seus profissionais de saúde sejam mais proativos em seus cuidados.

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